1927年4月12日,蒋介石发动反革命政变,中共莆田党组织遭受严重破坏,然而,他们并没有屈服,而是改变形式转入地下斗争。同年下半年,中共莆田特委在莆田城隍庙设立特别支部,继续与反动派展开斗争。该庙现位于荔城区长寿街庙前巷,始建于明洪武二年(1369年),如今仅存一座正殿。
由于国民党反动派疯狂镇压,中共莆田党组织遂把活动中心转移到农村。1928年,中共莆田特委在今涵江区白沙镇东泉村创办全县第一所列宁小学。该校旨在传播马列主义,培养革命接班人,专门吸收贫苦农民、农会会员和红军游击队员子女入学,分为高、中、初级三个班,现已列为区级重点文物保护单位。
同年,中共仙游县党组织则发动群众开展抗烟苗捐斗争,当时,中共党员王于洁在榜头镇坝下小学组织成立抗鸦片捐清算委员会,并以此为据点,秘密召开会议部署,会址在该校原教师办公楼。
1930年,中共领导的莆田革命斗争蓬勃发展,成为闽中重点地区。中共闽中特委先后在城乡各地建立地下交通站,今涵江区梧塘镇沁后小学(原省三小学)就留有遗址,建国后分别任中央与省领导的邓子恢、黄国璋等人当年均曾在此活动过。1985年,时任福建省委书记项南特地为该校题写校名。
同年12月,中共闽中特委在今涵江区新县镇外坑村建立闽中地区第一个红色政权——莆田外坑乡苏维埃政府。它位于该村宣德宫,系清咸丰十一年(1861年)重修留下的。现已列为区级重点文物保护单位。
1932年,中共闽中地下党组织在今秀屿区东峤镇前沁村创办前沁盐场盐民学校,以组织广大盐民抗捐抗税,开展游击斗争。该校遗址为清代建筑普应亭,占地达2000平方米。
为打击国民党反动统治,中共莆田党组织大力发展工农武装。1930年8月,中共福建省委派遣黄琬来莆领导革命武装斗争,建立中国工农红军第23军207团,黄琬任团长,陈天章任政委。其团部位于今涵江区白沙镇澳东村澳柄宫,现已列为区级重点文物保护单位。
同年秋季,中国工农红军第108团在仙游县钟山镇麦斜村成立,由中共党员黄扬、林石等带领的武工队改编而成。其团部遗址在该村麦斜岩寺,始建于宋代,现已列为县级重点文物保护单位。
此外,今荔城区新度镇中和寺也是当年革命活动地。1932年10月,中共福建省委派遣邓子恢来莆,在该寺主持召开福建省总行委扩大会议,向全省各地党组织代表传达闽西革命斗争经验,部署新的斗争方略。